De taken van deputaten kerkelijke archieven zijn:
- het zorgdragen voor het beheer van het archief van de generale synode en de synodale deputaatschappen;
- het adviseren van de archivarissen van de andere kerkelijke vergaderingen en van plaatselijke kerken bij het beheren en bewerken van hun archief;
- het verantwoordelijk zijn voor het landelijk Documentatiecentrum in Veenendaal.